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TUhjnbcbe - 2020/12/13 12:45:00

导语

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癌症图像档案(TheCancerImagingArchive,TCIA)是一项可以de-identify和托管可供公众下载的大量癌症医学图像的服务。

数据库介绍

癌症图像档案(TheCancerImagingArchive,TCIA)是一项可以de-identify和托管可供公众下载的大量癌症医学图像的服务。在TCIA中,数据被组织为“collections”;典型的病人与常见病(如肺癌)相关的影像、影像形态或类型(MRI、CT和digitalhistopathology等)或研究重点。DICOM是TCIA用于放射影像的主要文件格式。也提供了可用的与图像相关的支持数据,如患者结果、治疗细节、基因组学和专家分析。

NewCollectionproposals由TCIAAdvisoryGroup审阅。如果获得批准,数据收集中心(DCC)将为图像提供商提供亲身实践的(hands-on)支持,以de-identify和管理他们的数据。数据经过处理后,可以通过四种不同的方式供用户访问:

可以从首页访问Collection摘要页面,其中提供了每个数据集的详细说明以及直接下载链接,快速获取给定Collection的所有图像和支持数据。放射学和组织病理学数据门户提供更高级的搜索、浏览和过滤功能,以选择图像子集或从满足搜索标准的多个集合下载图像。编程接口(RESTAPI)允许软件开发人员在他们的脚本和应用程序中构建对TCIA数据的访问。TCIA还鼓励创建数据分析中心(DACs),DACs通过连接到TCIARESTAPI或镜像Collections,为可视化或分析TCIA数据提供了额外的功能。为了提高TCIA的collections的价值,TCIA也鼓励研究人员发表他们的分析结果。潜在的分析可能包括肿瘤分割、放射组学特征、导出/再处理图像和放射学家评估。用户可以在分析结果目录中查看其他TCIA用户发布的分析。

TCIA最初是由圣路易斯的华盛顿大学创建并主持的。年12月,国家癌症研究所(NCI)通过Fredrick国家实验室与华盛顿大学签订合同,建立一个高可用性、基于集群的托管环境,用以收集和管理当前和未来的图像collections。年10月,Prior博士和TCIA核心团队从华盛顿大学梅林克勒德学院放射科研究所迁至阿肯色大学医学院(UAMS)生物医学信息系。年10月,UAMS为TCIA创建了一个新的托管环境,所有的软件、流程和数据都从圣路易斯转移到了小石城。档案继续为世界各地的癌症研究人员提供高质量、高价值的图像collections。

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