今年，无创产前检测技术（NIPT）可谓一波未平一波又起。尽管NIPT自身仍存在部分的技术限制和局限性，但不可否认的是，这项技术使千万家庭避免了出生缺陷的悲剧发生，甚至还能提早发现母体中所存在的恶性肿瘤。
通常提到NIPT，大家想到的就是无创产前筛查。但近日的一项研究表明，NIPT检测平台还能用于女性癌症的复发预测！是不是很吃惊？
拷贝数变化（CNA）在ctDNA中的表征可作为肿瘤生物标志物。随着研究的不断深入，NIPT越来越多地被认为在CNA检测中有着广阔的应用前景。既然NIPT在CNA中的应用价值如此之大，CNA又在肿瘤中起着重要作用，那么利用NIPT平台检测CNAs，能否用于预测女性癌症的预后和复发呢？
为确定NIPT平台的这一新应用场景，来自日本的研究人员通过一项前瞻性研究对该设想进行了验证。他们发现NIPT检测平台也可以捕获ctDNA中的CNAs，这使NIPT成为一种检测癌症的无创经济有效的方法成为可能。
年7月26日，研究人员在Nature子刊ScientificReport发表了相关研究成果。文章报道称，研究团队利用NIPT方法能够检测到约20%女性癌症的CNAs，且在检测晚期癌症中的检测效果更显著，还发现检测到CNA患者的预后较差。
该前瞻性研究共纳入名女性癌症患者，包括36名卵巢癌患者、11名宫颈癌患者和53名子宫内膜癌患者。研究人员收集了患者的术前血浆样本，样本被随机地重新排列，使用低覆盖率的NIPT平台，对样本进行了CNA检测。
研究流程图
研究中，研究人员利用cfDNA片段数目（SeqFF）方法检测了CNA。在NIPT检测中，利用SeqFF方法检测胎儿CNA，依赖于胎儿和母体cfDNA之间的片段长度差异。所以研究人员设定了一个假设，即母体ctDNA和cfDNA的片段长度也不同。
我们知道全基因组检测CNA在ctDNA中的表征，使ctDNA可以作为具有优异灵敏度和特异性的肿瘤生物标志物。但这方法需要深度测序，会显著增加临床实践中的使用成本和难度。而已有研究表明，通过低覆盖全基因组测序对cfDNA中的染色体不稳定性分析可以用于卵巢癌的初步诊断。一些产前检测研究也证明了使用基于全基因组测序NIPT检测胎儿CNV的可能性。
研究结果显示，通过低覆盖NIPT检测，共检测到例女性癌症中的19例，包括36例卵巢癌中的6例，11例宫颈癌中的3例，53例子宫内膜癌中的10例。此外，NIPT能够更好的检测晚期癌症中的CNAs，晚期病例的总检出率为37%，而早期病例的总检出率为12%。包括21例早期卵巢癌中的1例，15例晚期卵巢癌中的5例，11例早期宫颈癌中的3例，41例早期子宫内膜癌中的5例，12例晚期子宫内膜癌中的5例，未发现晚期宫颈癌患者。
研究中检测到6例卵巢癌，3例子宫颈癌和10例子宫内膜癌的CNA
研究人员发现，与未检到CNA的患者相比，检测到CNA患者的无进展生存期和总体生存期均较低，因此CNA可作为癌症预后的生物标志物。并且子宫内膜癌患者往往携有影响癌症驱动基因，如MYC和CCNE1的改变。而恰好其中一些受影响的基因也是药物靶点。
此外，他们还检测到影响特定基因的CNA。除了一人外，所有的CNAs卵巢癌患者都有BRCA1或BRCA2的拷贝数丢失。同时，他们还发现了影响PI3K/Akt信号通路基因的CNA。
以上研究表明，低覆盖率全基因组测序的NIPT平台可以有效识别早期和晚期女性癌症，并预测其复发，尤其在晚期癌症中的预测效果更好。NIPT平台识别血浆中CNA的能力具有许多潜在的临床应用价值，这为检测孕妇潜在侵袭性癌症的提供了难得的机会，也为术后女性癌症复发预测提供了一个选择。
但研究人员表示，这项研究的样本规模很小，而且没有比较血浆DNA和肿瘤数据以确认CNA的起源，还需要临床研究来验证。尽管其临床应用还有待进一步研究确认，但NIPT检测在基因诊断方面确实具有更广阔的应用前景。例如利用ctDNA检测癌症和预测预后。
NIPT检测最终可以用于非侵入性癌症的诊断，以及监测复发和治疗反应。随着测序技术的发展和研究的深入，在临床肿瘤治疗中，更实惠、无创和纵向监测的工具将更有价值。
参考文献：
1.NIPTPlatformCanDetectCopyNumberAlterationsinSomeGynecologicalCancers
2.Massivelyparallelsequencingofcell-freeDNAinplasmafordetectinggynaecologicaltumour-associatedcopynumberalteration
·END·
预览时标签不可点收录于话题#个上一篇下一篇